رغم أن مقتضيات تنفيذ مهمة شئون الجمارك هي متعددة الأوجه، إلا أنه بالإمكان توضيحها في أربعة محاور أساسية مختلفة:
المساهمة الكبيرة في الاقتصاد الوطني.
تعزيز حركة السفر والتجارة المشروعة.
حماية ووقاية البحرين من المواد الممنوعة والمقيدة.
تأمين حدودنا البرية والجوية والبحرية.
تقديم خدمات جمركية متميزة على مستوى الإقليم من خلال تيسير حركة السفر والتجارة المشروعة وتعزيز أمن المملكة وحماية المجتمع